交通运输工程学科于2008年开始培育，2013年获硕士学位授权点，2018年3月入选福建省“双一流”高原学科，由交通运输学院、电子电气与物理学院等共同建设。其中，电子电气与物理学院主要负责智能驾驶与交通安全学科方向。
本学科为省一级重点学科和硕士学位授权学科，积极服务海西区域经济社会发展，近五年承担交通运输相关科研项目近100项，获资助总金额3500余万元。智能驾驶与交通安全学科方向依托福建省汽车电子与电驱动技术、数字福建交通大数据研究所等重点学科平台，主要聚焦于福建省交通系统的安全性与智能化，致力于解决交通事故、碳排放等关键问题，主要研究课题包括营运车辆卫星定位安全监管终端与平台研发、新能源汽车T-BOX研发、新能源汽车充电桩及其系统研发、新能源汽车大数据挖掘分析、智能驾驶关键技术研发与测试等，并通过电池大数据挖掘分析等研究课题，实现与新一代电子信息技术、电气工程等学科的交叉融合。近年来获福建省科学技术进步奖、中国产学研创新成果奖等科研奖励5项。